Questions avec tag [snakemake]

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le mode emacs pour snakemake?
Créé 15/06/2013 à 20:08
utilisateur user2489449
Créé 11/08/2015 à 10:03
utilisateur Marcel M
Créé 24/08/2015 à 10:52
utilisateur rioualen
Créé 31/08/2015 à 14:40
utilisateur rioualen
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537
règle toujours courir dans Snakefile (snakemake)
Créé 08/04/2016 à 10:05
utilisateur Chris
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202
programmation de pipeline en parallèle
Créé 17/06/2016 à 18:21
utilisateur VickiT05
Créé 21/06/2016 à 20:27
utilisateur VickiT05
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776
Re-écriture de fichier protégé en écriture
Créé 29/06/2016 à 13:04
utilisateur VickiT05
Créé 08/07/2016 à 07:49
utilisateur The Unfun Cat
Créé 26/10/2016 à 11:12
utilisateur bli
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466
Comment faire une partie à élargir Snakemake?
Créé 03/11/2016 à 09:37
utilisateur bli
Créé 09/11/2016 à 15:19
utilisateur bli
Créé 09/11/2016 à 15:53
utilisateur user3213137
Créé 10/11/2016 à 23:08
utilisateur blaurent
Créé 13/11/2016 à 10:13
utilisateur Stephan
Créé 15/11/2016 à 05:49
utilisateur Andreas
Créé 18/11/2016 à 00:27
utilisateur olala
Créé 18/11/2016 à 21:04
utilisateur olala
Créé 21/11/2016 à 02:28
utilisateur Andreas
Créé 21/11/2016 à 21:36
utilisateur Harold
Créé 22/11/2016 à 15:39
utilisateur Andreas
Créé 23/11/2016 à 16:43
utilisateur fitziano
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346
Snakemake: dépendances qui ne sont pas entrée
Créé 25/11/2016 à 10:27
utilisateur blaurent
Créé 02/12/2016 à 16:09
utilisateur bli
Créé 02/12/2016 à 21:40
utilisateur olala
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182
Nom de règle actuelle Snakemake
Créé 05/12/2016 à 13:59
utilisateur glihm
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Snakemake: supprimer le fichier de sortie
Créé 06/12/2016 à 13:30
utilisateur blaurent
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La réutilisation d'une règle dans Snakemake
Créé 06/12/2016 à 16:17
utilisateur glihm
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Installation snakemake sans Internet
Créé 11/12/2016 à 18:36
utilisateur MichelleN
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Snakemake + tmux
Créé 11/12/2016 à 19:26
utilisateur domino55
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snakemake questions LSF
Créé 13/12/2016 à 12:38
utilisateur naamako
Créé 14/12/2016 à 05:57
utilisateur kdmurrray91
Créé 16/12/2016 à 13:31
utilisateur bli
Créé 20/12/2016 à 19:57
utilisateur Jon
Créé 04/01/2017 à 13:59
utilisateur Gil Hornung
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299
L'utilisation regex dans snakemake wildcards
Créé 04/01/2017 à 14:07
utilisateur rioualen
Créé 12/01/2017 à 17:49
utilisateur vtrubets
Créé 13/01/2017 à 17:01
utilisateur Zuup
Créé 16/01/2017 à 11:52
utilisateur rioualen
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307
Traitement par lots: GNU make, Snakemake ou quoi?
Créé 17/01/2017 à 13:55
utilisateur Robyc
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453
utiliser des paramètres multiples dans snakemake
Créé 20/01/2017 à 16:16
utilisateur Kam Sen
Créé 27/01/2017 à 16:40
utilisateur Zuup
Créé 15/02/2017 à 16:08
utilisateur bli
Créé 21/02/2017 à 10:44
utilisateur Zuup
Créé 06/03/2017 à 15:42
utilisateur Mesmer
Créé 08/03/2017 à 15:27
utilisateur Veera
Créé 16/03/2017 à 14:21
utilisateur bli
Créé 16/03/2017 à 15:36
utilisateur lvw
Créé 17/03/2017 à 07:55
utilisateur Kolja
Créé 22/03/2017 à 05:56
utilisateur RNA
Créé 24/03/2017 à 18:18
utilisateur Veera




Créé 28/03/2017 à 15:14
utilisateur lvw
Créé 30/03/2017 à 16:51
utilisateur crazyhottommy
Créé 10/04/2017 à 16:01
utilisateur Zen
Créé 12/04/2017 à 15:00
utilisateur msakya
Créé 07/05/2017 à 14:43
utilisateur hetica
Créé 11/05/2017 à 11:22
utilisateur tdido
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Problème Snakemake Cluster Présentation SGE
Créé 16/05/2017 à 20:56
utilisateur x.Doan
Créé 23/05/2017 à 10:03
utilisateur Anna Jeanine
Créé 25/05/2017 à 01:54
utilisateur TBoyarski
Créé 25/05/2017 à 08:22
utilisateur user3015703
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88
L'utilisation pyenv dans une règle de snakemake
Créé 01/06/2017 à 19:55
utilisateur rbrisk
Créé 08/06/2017 à 00:02
utilisateur TBoyarski
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236
MissinOutputException à snakemake
Créé 09/06/2017 à 08:32
utilisateur Jokhe
Créé 15/06/2017 à 07:23
utilisateur user3015703
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snakemake d'erreur Thread.py
Créé 18/06/2017 à 14:35
utilisateur user3015703
Créé 22/06/2017 à 14:24
utilisateur user3015703
Créé 27/06/2017 à 16:52
utilisateur Jon
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Restez sur distance S3 RemoteProvider
Créé 27/06/2017 à 16:56
utilisateur K.Lai
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sortie dynamique snakemake
Créé 29/06/2017 à 01:16
utilisateur ate50eggs
Créé 04/07/2017 à 14:04
utilisateur Alexandre.S
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80
enregistrement de commande Wrapper: Snakemake
Créé 12/07/2017 à 01:04
utilisateur sebio
Créé 14/07/2017 à 21:26
utilisateur Bruno Grande
Créé 21/07/2017 à 20:09
utilisateur Vivek-Bh
Créé 25/07/2017 à 13:13
utilisateur mau_who
Créé 26/07/2017 à 16:58
utilisateur bli
Créé 28/07/2017 à 13:34
utilisateur bli
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36
paramètres enchaînés dans SnakeMake
Créé 28/07/2017 à 21:18
utilisateur tedtoal
Créé 01/08/2017 à 16:20
utilisateur mau_who
Créé 03/08/2017 à 02:20
utilisateur TBoyarski
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64
Où rapporter des suggestions pour SnakeMake
Créé 03/08/2017 à 18:51
utilisateur tedtoal
Créé 03/08/2017 à 20:34
utilisateur tedtoal
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475
snakemake wildcards ou commande expand
Créé 04/08/2017 à 13:49
utilisateur mau_who
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121
snakemake configuration d'accès à la sortie
Créé 04/08/2017 à 18:16
utilisateur Matt
Créé 07/08/2017 à 18:44
utilisateur tedtoal
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32
Comment snakemake nom du script accessible?
Créé 07/08/2017 à 22:33
utilisateur tedtoal
Créé 08/08/2017 à 16:39
utilisateur Zuup
Créé 08/08/2017 à 20:09
utilisateur tedtoal
Créé 09/08/2017 à 10:37
utilisateur mau_who
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89
Snakemake: + dynamique sortie non dynamique
Créé 09/08/2017 à 20:10
utilisateur Sean Colby
Créé 10/08/2017 à 08:09
utilisateur bli
Créé 10/08/2017 à 12:33
utilisateur rioualen
Créé 10/08/2017 à 23:44
utilisateur tedtoal
Créé 16/08/2017 à 13:56
utilisateur tdido
Créé 17/08/2017 à 06:39
utilisateur Jan Schreiber
Créé 17/08/2017 à 21:08
utilisateur yevishere
Créé 18/08/2017 à 20:59
utilisateur tedtoal
Créé 18/08/2017 à 21:42
utilisateur yevishere
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53
flux de travail débranchement
Créé 19/08/2017 à 04:58
utilisateur domino55
Créé 21/08/2017 à 10:47
utilisateur merella.stefania
Créé 21/08/2017 à 16:15
utilisateur Alistair Miles




Créé 21/08/2017 à 20:42
utilisateur yevishere
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85
Mémoriser le résultat d'une commande shell
Créé 28/08/2017 à 09:01
utilisateur khikho
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105
Utilisation de argparse dans le script Snakemake
Créé 30/08/2017 à 23:57
utilisateur JeeYem
Créé 31/08/2017 à 20:44
utilisateur tedtoal
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39
Toute analyse de la voie écrite en snakelike
Créé 31/08/2017 à 22:54
utilisateur user977828
Créé 05/09/2017 à 22:00
utilisateur tedtoal
Créé 06/09/2017 à 03:57
utilisateur mitoRibo
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119
commande tactile Snakemake
Créé 06/09/2017 à 10:13
utilisateur mau_who
Créé 08/09/2017 à 16:32
utilisateur hardingnj
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37
fichier proxy sur le code snakemake
Créé 11/09/2017 à 14:11
utilisateur mau_who
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134
Plusieurs « params » dans le fichier Snakemake
Créé 13/09/2017 à 10:00
utilisateur Michael Schubert
Créé 13/09/2017 à 13:06
utilisateur Michael Schubert
Créé 19/09/2017 à 12:53
utilisateur user4249654
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80
snakemake comment coder paire analisys
Créé 19/09/2017 à 21:56
utilisateur mau_who
Créé 25/09/2017 à 06:25
utilisateur tedtoal
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117
règles Snakemake
Créé 25/09/2017 à 06:43
utilisateur jk_kim
Créé 25/09/2017 à 20:18
utilisateur mau_who
Créé 26/09/2017 à 12:51
utilisateur mgalardini
Créé 26/09/2017 à 13:36
utilisateur Rewati Tappu
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Contraintes d'entrée Wildcard Snakemake
Créé 01/10/2017 à 00:58
utilisateur Mike Dacre
Créé 02/10/2017 à 15:45
utilisateur hardingnj
Créé 04/10/2017 à 01:24
utilisateur bwubb
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La gestion des erreurs SIGPIPE dans snakemake
Créé 04/10/2017 à 15:56
utilisateur dariober
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57
temps de latence pour snakemake
Créé 06/10/2017 à 12:00
utilisateur mau_who
Créé 08/10/2017 à 17:12
utilisateur sharchaea
Créé 08/10/2017 à 22:50
utilisateur tedtoal
Créé 12/10/2017 à 16:25
utilisateur David M
Créé 13/10/2017 à 16:08
utilisateur bwubb
Créé 18/10/2017 à 15:03
utilisateur bli
Créé 19/10/2017 à 07:17
utilisateur Kim
Créé 20/10/2017 à 19:23
utilisateur Sajber
Créé 20/10/2017 à 20:14
utilisateur Colin
Créé 24/10/2017 à 10:32
utilisateur Sajber
Créé 26/10/2017 à 06:38
utilisateur Cerikson
Créé 26/10/2017 à 07:43
utilisateur A. Fust
Créé 27/10/2017 à 13:03
utilisateur bwubb
Créé 03/11/2017 à 02:44
utilisateur SlowLearner
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45
snakemake filtrage des fichiers dynamiques
Créé 03/11/2017 à 10:23
utilisateur Fenrir
Créé 03/11/2017 à 18:22
utilisateur bli
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snakemake: jokers changent en fonction d'entrée
Créé 07/11/2017 à 02:21
utilisateur Cerikson
Créé 07/11/2017 à 15:03
utilisateur ezhao15
Créé 09/11/2017 à 21:47
utilisateur mau_who
Créé 10/11/2017 à 04:16
utilisateur tedtoal
Créé 12/11/2017 à 12:44
utilisateur pirovc
Créé 13/11/2017 à 15:15
utilisateur Carlus
Créé 13/11/2017 à 16:32
utilisateur Carlus
Créé 15/11/2017 à 20:12
utilisateur JeeYem
Créé 15/11/2017 à 23:46
utilisateur dugar
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23
Activation des options dans snakefile
Créé 20/11/2017 à 17:52
utilisateur tedtoal
Créé 20/11/2017 à 23:13
utilisateur Barry Moore




Créé 21/11/2017 à 14:20
utilisateur Kamil S Jaron
Créé 24/11/2017 à 09:57
utilisateur rioualen
Créé 29/11/2017 à 14:50
utilisateur l0o0
Créé 01/12/2017 à 19:49
utilisateur JeeYem
Créé 04/12/2017 à 14:55
utilisateur fiona
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103
comment wildcards dans les règles, Snakemake
Créé 04/12/2017 à 19:52
utilisateur Yan W.
Créé 05/12/2017 à 04:14
utilisateur Hirak Sarkar
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34
Trop de fichiers dans le dossier `.snakemake`
Créé 12/12/2017 à 12:24
utilisateur Jan Schreiber
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21
comment trouver le référentiel droit
Créé 14/12/2017 à 01:56
utilisateur Anlin Li
Créé 18/12/2017 à 16:36
utilisateur par
Créé 19/12/2017 à 14:29
utilisateur Jonathan Manning
Créé 19/12/2017 à 19:33
utilisateur Bharat
Créé 22/12/2017 à 09:32
utilisateur Tjitske
Créé 28/12/2017 à 06:29
utilisateur Daniel Standage
Créé 28/12/2017 à 14:15
utilisateur rioualen
Créé 05/01/2018 à 08:37
utilisateur Anlin Li
Créé 05/01/2018 à 11:05
utilisateur rioualen
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wildcards manquant dans l'objet de S4 en R
Créé 05/01/2018 à 17:08
utilisateur Patrick Roelli
Créé 09/01/2018 à 12:18
utilisateur Chris
Créé 09/01/2018 à 18:16
utilisateur fakechek
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63
règle ne repris par snakemake
Créé 10/01/2018 à 15:29
utilisateur yahan
Créé 11/01/2018 à 21:16
utilisateur user1973192
Créé 15/01/2018 à 13:00
utilisateur Julien Lagarde
Créé 19/01/2018 à 15:57
utilisateur Uri Laserson
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expression lambda sur des arguments d'entrée
Créé 21/01/2018 à 16:16
utilisateur khikho
Créé 24/01/2018 à 04:18
utilisateur Andreas
Créé 24/01/2018 à 14:03
utilisateur tfenne
Créé 25/01/2018 à 09:55
utilisateur yahan
Créé 25/01/2018 à 10:17
utilisateur fakechek
Créé 25/01/2018 à 13:03
utilisateur bapors
Créé 25/01/2018 à 19:50
utilisateur seandavi
Créé 28/01/2018 à 16:35
utilisateur Lucas van Dijk
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55
Snakemake mémoire limitant
Créé 31/01/2018 à 12:33
utilisateur bapors
Créé 01/02/2018 à 03:00
utilisateur Mike Dacre
Créé 01/02/2018 à 17:07
utilisateur anilbey
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19
Snakemake: multi-niveaux parsing JSON
Créé 06/02/2018 à 09:24
utilisateur Nicolas Rosewick
Créé 07/02/2018 à 17:30
utilisateur user9328894
Créé 07/02/2018 à 19:02
utilisateur Thomas Moody
Créé 08/02/2018 à 12:37
utilisateur anilbey
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InputFunctionException avec KeyError
Créé 09/02/2018 à 16:08
utilisateur user3015703
Créé 09/02/2018 à 20:34
utilisateur K.Lai
Créé 09/02/2018 à 20:36
utilisateur mau_who
Créé 12/02/2018 à 13:35
utilisateur Nicolas Rosewick
Créé 14/02/2018 à 10:03
utilisateur user9328894
Créé 14/02/2018 à 11:32
utilisateur Nicolas Rosewick
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66
sortie hiérarchique dynamique snakemake
Créé 15/02/2018 à 12:08
utilisateur kiero
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41
Snakemake ne joue pas bien avec wget
Créé 16/02/2018 à 00:35
utilisateur conchoecia
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33
Snakemake: comment changer tabulation littérale
Créé 20/02/2018 à 15:21
utilisateur Nicolas Rosewick
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79
Créer manuellement wildcards snakemake
Créé 21/02/2018 à 15:09
utilisateur fakechek

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